Puskesmas Wonokerto II merupakan Puskesmas Rawat Inap yang berada di wilayah Pemerintah Kabupaten Pekalongan secara resmi berdiri pada 2 Januari 2014. Puskesmas Wonokerto II beralamat di Jalan Raya Werdi - Wiradesa Kecamatan Wonokerto Kabupaten Pekalongan dengan luas wilayah kerja sekitar 3,18 KM² yang terdiri dari 3 desa yaitu Desa Werdi, Desa Rowoyoso, dan Desa Semut.